Príznaky sa objavujú medzi 10 a 15 dní po uhryznutí infikovaným hmyzom. Niektoré druhy parazitov malárie (Plasmodium vivax et Plasmodium ovale) môžu zostať neaktívne v pečeni niekoľko týždňov alebo dokonca mesiacov, než sa objavia prvé príznaky.

Malária sa vyznačuje opakovanými záchvatmi, ktoré pozostávajú z troch fáz:

• Zimnica;
• Bolesti hlavy;
• Únava a bolesť svalov;
• Nevoľnosť a zvracanie;
• Hnačka (príležitostne).

O hodinu alebo dve hodiny neskôr:

• Vysoké horúčky;
• Koža sa stáva horúcou a suchou.

Potom telesná teplota klesne:

• Silné potenie;
• Únava a slabosť;
• Postihnutý zaspí.

Infekcie malárie P. vivax a P. ovale môžu relapsovať niekoľko týždňov alebo dokonca mesiacov po prvej infekcii, aj keď pacient opustil oblasť infekcie. Tieto nové epizódy sú dôsledkom „spiacich“ pečeňových foriem.