Un bakteriologické vyšetrenie alebo analýza umožňuje nájsť a identifikovať baktérie zapojené do a infekcie.

V závislosti od miesta infekcie je možné vykonať niekoľko analýz:

• bakteriologické vyšetrenie moč alebo ECBU
• bakteriologické vyšetrenie stoličky (pozri kultúru stoniek)
• bakteriologické vyšetrenie cerviko-vaginálne sekréty u žien
• bakteriologické vyšetrenie spermie u ľudí
• bakteriologické vyšetrenie prieduškové sekréty alebo spúta
• bakteriologické vyšetrenie výtery z hrdla
• bakteriologické vyšetrenie boláky na pokožku
• bakteriologické vyšetrenie cerebrospinálna tekutina (pozri lumbálna punkcia)
• bakteriologické vyšetrenie krv (pozri krvnú kultúru)

Tento typ vyšetrenia nie je systematicky predpisovaný v prípade infekcie. Lekár najčastejšie v prípade infekcie bakteriálneho pôvodu predpisuje antibiotiká empiricky, to znamená „náhodne“, čo vo väčšine prípadov stačí.

Niekoľko situácií však môže vyžadovať odobratie vzorky a presnú bakteriologickú analýzu:

• infekcia u osoby s oslabenou imunitou
• infekcia, ktorá sa nehojí antibiotikami (a preto je pravdepodobne odolná voči prvým podaným antibiotikám)
• nozokomiálna infekcia (vyskytuje sa v nemocnici)
• potenciálne závažná infekcia
• kolektívna otrava jedlom
• pochybnosti o vírusovej alebo bakteriálnej povahe infekcie (napríklad v prípade angíny alebo faryngitídy)
• diagnostika určitých infekcií, ako je tuberkulóza
• a tak ďalej